O movimento sindical de trabalhadores rurais era incipiente, na década de 60. Aqui em Goiás havia uma Delegacia Regional da CONTAG – CONFEDERAÇÃO NACIONAL DOS TRABALHADORES NA AGRICULTURA, instalada por volta de 1966, com a finalidade de coordenar e defender os interesses dos trabalhadores rurais no Estado de Goiás, encarregando-se, também, da fundação de sindicatos de trabalhadores rurais no Estado.

O primeiro sindicato de trabalhadores rurais fundado em Goiás é o de Anápolis, cuja fundação ocorreu em 04 de junho de 1967. Depois dele, outros sindicatos foram sendo fundados, como os de Pirenópolis, Goianápolis, Nova Veneza, Caturaí e Catalão.

Em 28 de outubro de 1970, os seis (6) sindicatos de trabalhadores rurais acima nominados reuniram-se, em Goiânia, e fundaram a FEDERAÇÃO DOS TRABALHADORES RURAIS NA AGRICULTURA FAMILIAR DO ESTADO DE GOIÁS, criada com a finalidade de coordenar e defender os interesses dos trabalhadores rurais goianos. A partir da fundação da FETAEG novos Sindicatos de Trabalhadores Rurais foram sendo criados no Estado, tendo a igreja católica desempenhado um papel significativo, apoiando e incentivando os trabalhadores, na década de 70, na criação de novas entidades sindicais.

O primeiro Presidente da FETAEG foi o sr. Antônio Ferreira Bueno (hoje falecido). Ele dirigiu a Federação, como Presidente, desde sua fundação até o dia 30 de março de 1981, quando, pressionado por significativo número de representantes de sindicatos de trabalhadores rurais goianos que, há bastante tempo, já lutavam contra sua permanência à frente da FETAEG, por entenderem que ele não pertencia, efetivamente, à categoria de trabalhadores rurais, renunciou ao cargo de Presidente. O então vice-presidente da entidade, sr. Amparo Sesil do Carmo, assumiu o cargo de Presidente da FETAEG, tendo sido reeleito para o mesmo cargo no período de 1983 a 1986.

No período de 1986 a 1989 a FETAEG teve como Presidente o sr. Divino Goulart da Silva, reeleito para o período de 1989 a 1992. De 1992 a 1995 a FETAEG foi presidida pelo sr. Guilherme Pedro Neto e nos triênios 1995/1998 e 1998 a 2001 quem exerceu a Presidência da FETAEG foi o sr. Alair Luiz dos Santos. No período de agosto de 2001 a agosto de 2008 foi presidida pelo Sr. Wilson Hermth Gottens. O Sr. Elias D´angelo Borges, presidio no período de agosto de 2008 a Abril de 2013.